In progetti di separazione speciali, la tecnologia a membrana per il trattamento dell'acqua viene utilizzata principalmente per la concentrazione del materiale, il trattamento delle acque reflue dei coloranti e la separazione delle proteine ​​nei prodotti biofarmaceutici. Le tecnologie a membrana di nanofiltrazione e l'elettrodialisi svolgono un ruolo nella separazione selettiva in questi campi, come la nanofiltrazione per la separazione di sostanze con differenze di peso molecolare e l'elettrodialisi per gestire il recupero di acidi e alcali. La purificazione a valle nei prodotti biofarmaceutici richiede l'ultrafiltrazione e la microfiltrazione per rimuovere virus o detriti cellulari e garantire la purezza e la sicurezza del prodotto.